Instructions for Construction

Architects, engineers and designers refer to a blueprint when they are constructing something. A blueprint is a technical drawing that has all the details of what and how something is constructed.

Now, how about the human body? Where is all the information about what our bodies need to do stored? 

Each cell in our body has its own job. Some cells help us detect light and see, other cells carry oxygen around, while some cells help us digest food by secreting enzymes. There are over 200 cell types in the body - that is 200 different jobs!

But how does each cell know what job to do? Our cells are told what to do by a very special molecule called DNA, which is like a blueprint. DNA is shaped like a twisted ladder, called the double helix. The letters of the DNA, called bases, make up the rungs, whereas special sugars and other atoms make up the handrail. The rungs are very special. Each one has a name, but they are usually referred to by their initials: A, T, C and G. A good way of looking at it is that A, T, G and C are like jigsaw pieces. A and T fit together, C and G fit together - you cannot force a jigsaw piece to fit with a wrong piece!

Think of all the words you can spell. Each word is made using the same selection of letters. Depending on how we arrange the letters of the alphabet we can make new words. The same is true in the four letter alphabet of DNA. These letters form a sentence, and each sentence tells a cell to make a special molecule called a protein. These proteins in turn, are like little tiny workers scurrying about in the cell transporting other molecules, rearranging molecules, repairing the cell, getting rid of wastes, making the cell move, and also, constructing newer cells. 

Experiment: To extract DNA from an onion

Materials 

distilled water, baking soda, salt, shampoo, ethanol, onion, and a sieve.

Steps:

1. Prepare the buffer solution by mixing a bottleful of water with a teaspoon of salt, 3 teaspoons of baking soda, and 3 teaspoons of shampoo. 

2. Keep this buffer solution in a refrigerator.

3. Next, take an onion and mince it to pieces, or crush it with a blender.

4. Collect the pulp in a tall glass container.

5. Take a tablespoon of the mashed up onion and mix it with the chilled buffer solution. Stir it for 3 minutes and then leave it in the freezer for 5 minutes.

6. Remove the bits and pieces of onion by filtering it through a sieve. You now have a solution.

7. Slowly add cold ethanol to the solution by trickling it down the sides of the tall glass container.

8. The DNA will appear as a white cloud, which can be removed with a toothpick.

Glossary of terms:

Protein [proh-teen] - organic molecules constituting a large portion of the mass of every life form and necessary in the diet of all animals. 

Enzymes [en-zahym] – any of various proteins producing certain chemical changes by catalytic action.

Shared by Surain A. Victor
Guest Blogger

https://surainawesome.wordpress.com/

Kad Pengenalan Haiwan!

Jika diperhatikan pada gambar kupu-kupu di atas, mungkin kita terfikir yang mereka adalah sama semuanya. Mungkin ramai juga yang berpendapat  bahawa  mereka  adalah  sama kerana  dari sudut fizikalnya, kupu-kupu di atas kelihatan sama. Tetapi,  tahukah  anda bahawa  rupa yang sama tidak semestinya menentukan sesuatu organisma itu berasal dari spesies yang sama. Mereka  mungkin berlainan spesies antara satu sama lain. 

Melalui sistem pengkelasan dan taksonomi dalam tatanama biologi spesifikasi untuk haiwan dan berpandukan pada gambar di bawah, 'Satyrium' adalah genus manakala  'saepium' adalah spesies. Sekiranya nama saintifik lain seperti Felix Domestica, maka 'Felix' adalah genus manakala 'domestica' adalah spesies. Dalam erti kata lain, sesuatu spesies itu mungkin berasal dari genus yang sama tetapi berlainan spesies. Dalam contoh di bawah, kedua-duanya adalah berasal daripada genus yang sama iaitu 'Satyrium' tetapi mereka  berlainan spesies.

Teknik yang digunakan bagi penentuan spesies dinamakan 'Barcoding DNA' atau Kod Bar DNA. Kod bar ini  digunakan dalam usaha untuk mengenal pasti spesies yang tidak diketahui atau menilai sama ada spesies perlu digabungkan atau dipisahkan. 

Kod Bar DNA  mencirikan spesies organisma menggunakan urutan DNA pendek daripada kedudukan dalam genom. Genom adalah semua maklumat genetik benda hidup yang dikodkan ke dalam DNA. Urutan kod bar DNA adalah relatif yang singkat untuk keseluruhan genom dan ia boleh didapati dengan cepat dan murah. Dalam erti kata lain, teknik ini adalah bersamaan dengan cara yang sama pengimbas pasar raya menggunakan jalur hitam kod bar untuk mengenal pasti sebarang pembelian.

Mengenal pasti spesies menggunakan kod bar DNA bermula dengan spesimen. Bahan spesimen ada yang diperolehi dari lapangan,  dari koleksi yang ditempatkan di muzium semulajadi,  zoo, taman botani dan di bank benih. Di dalam makmal, sekeping tisu kecil daripada spesimen di ambil untuk mengekstrak DNAnya. Urutan kod DNA kemudiannya akan diterjemahkan ke dalam bentuk turutan warna. Setiap warna mewakili asid nukleik tertentu samada C,T,A atau G - sitosin (C), adenin (A), tiamin(T) dan guanin(G). 

Sebagai contoh urutan DNA adalah  seperti CCTATACCTAATCTTCGGAGCATGAGCGGGCATGGTAGGC....

Dan imej bar kod akan kelihatan seperti dalam gambarajah di bawah:

Aplikasi kod bar DNA bukan hanya  digunakan  untuk organisma haiwan sahaja. Teknik ini turut digunakan dalam penentuan jenis daun tumbuhan dan serangga. 

Jadi, tidak semestinya sesuatu organisma itu sama spesiesnya walaupun rupa dan warna mereka kelihatan sama pada mata kasar kita. Teknik kod bar DNA pasti memberi penyelesaian terhadap Kad Pengenalan mereka! 

Posted by Ayu
Learning Specialist, Petrosains